体育教研部前身为基础医学部体育教研室，创建于1953年，是我校实施体育教育的专业部门。2003年4月，体育教研室从基础医学院分离出来，成立体育教研部，下设现代体育教研室和民族与传统体育教研室。承担学校体育教学、科研、群众体育、竞赛等各项任务，以及“国家学生体质健康标准”测试评价和数据统计工作。

体育教研部现有教职员工25人，其中专任教师21人（“双肩挑”2人），行政管理干部3人（编外1人），教辅1人（编外）。教师队伍平均年龄42岁，来自省内外各专业体育院校，其中教授1人，副教授10人，讲师5人，助教5人。专任教师中具有硕士学位19人，博士在读2人，是一支具有较高专业水平、团结而富有朝气的队伍。正是在这支队伍兢兢业业、勇于奉献下，体育教研部秉承更高更快更强的工作精神，拼搏奋进，取得一系列殊荣。

近年来体育教研部多次承担省部级、厅级立项课题研究，先后在国家正式刊物上发表学术论文70余篇,其中核心期刊10余篇。

体育教研部先后被评为“福建省高校贯彻《体育博彩论坛官网》先进单位”、“福建省高校开展群众性体育活动先进单位”、“福建省高校推行《博彩论坛》先进单位”、“华东区高等医学院校开展学校体育工作先进单位”等。2011年民族与传统体育教研室荣获“博彩论坛五一先锋岗”，2012年，体育教研部荣获省总工会颁发的“福建省工人先锋号”称号，2020年，民族与传统体育教研室荣获校“文明教研室”称号。